基于無(wú)人機(jī)高光譜數(shù)據(jù)的冬小麥SPAD聚類(lèi)回歸估測(cè)
背景:
SPAD值表示葉片中的相對(duì)葉綠素含量。葉綠素作為光合作用劑在小麥生長(zhǎng)和施肥管理中起著至關(guān)重要的作用。葉綠素是作物光合作用最重要的色素,其濃度變化直接影響作物的健康狀況在中國(guó),冬小麥?zhǔn)侵饕Z食作物之一,因此,對(duì)于小麥生長(zhǎng)監(jiān)測(cè)和田間肥料管理,有必要有效測(cè)定葉片葉綠素含量或SPAD。傳統(tǒng)上,葉綠素是在體外測(cè)量的,這種測(cè)量更精確,但具有破壞性、成本高昂且不適合大面積.對(duì)于使用SPAD的點(diǎn)采樣,SPAD值可以通過(guò)SPAD-502葉綠素儀測(cè)量,不受時(shí)間和氣候條件的限制。許多學(xué)者使用該儀器獲取小麥SPAD數(shù)據(jù)。近年來(lái),遙感技術(shù)已成為作物生長(zhǎng)監(jiān)測(cè)的重要工具。特別是基于無(wú)人機(jī)的低空遙感探測(cè)技術(shù)具有操作方便、靈活性快速、效率高、空間分辨率高等優(yōu)點(diǎn),在精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)中的得到了廣泛的應(yīng)用,最重要的是,它不受云層的影響,例如衛(wèi)星傳感器。此外,無(wú)人機(jī)遙感平臺(tái)可以攜帶多光譜和高光譜傳感器。由于高光譜傳感器具有高光譜分辨率和強(qiáng)波段連續(xù)性,因此可以準(zhǔn)確獲取冬小麥的光譜信息。根據(jù)葉綠素中太陽(yáng)輻射的吸收和反射,為植物生成了特定的光譜曲線。
在以往的研究中,小麥生長(zhǎng)信息是基于植被指數(shù)的高光譜數(shù)據(jù)中提取的。或支持向量回歸、隨機(jī)森林 (RF)、反向傳播神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和深度學(xué)習(xí)算法等方法監(jiān)測(cè)農(nóng)學(xué)參數(shù)。現(xiàn)有算法基于全局建模的思想,無(wú)法較大化地提高不同土壤肥力條件下小麥光譜特性的差異。此外,在同一生育期,不同施肥處理下的冬小麥光譜特征也存在顯著差異.因此,為了更好地探索不同土壤肥力條件下基于光譜差異的冬小麥SPAD濃度,采用聚類(lèi)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) 或必須使用局部建模(例如地理加權(quán)回歸模型 .差異化模型的目標(biāo)是根據(jù)光譜角距離(SAD)對(duì)小麥光譜進(jìn)行聚類(lèi),以區(qū)分不同肥力田的小麥光譜,然后構(gòu)建每個(gè)光譜聚類(lèi)的回歸模型。最近,集成學(xué)習(xí)算法 已被用于解決回歸問(wèn)題 ,因?yàn)樗鼈兙哂蟹夯芰徒7€(wěn)定性.
因此,本研究在安徽省孟城縣國(guó)家土壤質(zhì)量觀測(cè)實(shí)驗(yàn)站建立了兩步回歸模型估計(jì)田間冬小麥SPAD。采用K-means作為聚類(lèi)方法,并使用兩種類(lèi)型的集成學(xué)習(xí)算法作為回歸方法:基于提升集成策略的集成學(xué)習(xí)算法Extreme Gradient Boosting(XGBoost)和RF。比較了非聚類(lèi)回歸模型(RF、XGBoost)和聚類(lèi)回歸模型(聚類(lèi)-RF、聚類(lèi)-XGBoost)的性能,并評(píng)估了土壤有機(jī)質(zhì)(OM)和土壤全氮(TN)對(duì)小麥SPAD遙感估計(jì)的影響。
數(shù)據(jù)收集
本研究使用的數(shù)據(jù)包括基于無(wú)人機(jī)的高光譜成像數(shù)據(jù)、小麥SPAD和各樣地的土壤養(yǎng)分?jǐn)?shù)據(jù)。具體來(lái)說(shuō),利用搭載有高光譜成像系統(tǒng)的六旋翼無(wú)人機(jī)、用于穩(wěn)定性增強(qiáng)的云臺(tái)和高光譜成像儀組成。高光譜成像儀從 176 個(gè)光譜波段采集從可見(jiàn)光到近紅外 (400–1000 nm) 范圍的波長(zhǎng),光譜分辨率為 3.5 nm。高光譜數(shù)據(jù)是在無(wú)云和無(wú)風(fēng)的日子里采集的,包含空間分辨率為4.7 cm的高光譜立方體圖像。對(duì)于小麥SPAD數(shù)據(jù),我們使用手持式葉綠素儀(SPAD-502,)實(shí)時(shí)測(cè)量了田間126個(gè)采樣點(diǎn)的相對(duì)葉綠素含量。每個(gè)采樣點(diǎn)選取10個(gè)具有代表性的小麥植株,測(cè)量每個(gè)采樣點(diǎn)選取的旗葉,均勻選取每片葉的不同部位(避脈)測(cè)量SPAD,平均值計(jì)算為該采樣點(diǎn)葉片的最終SPAD值。對(duì)于土壤養(yǎng)分?jǐn)?shù)據(jù),從每個(gè)樣地中隨機(jī)選擇5個(gè)樣本點(diǎn),并混合成一個(gè)樣本。將土壤樣品在室溫下風(fēng)干,磨碎并混合以備后用。OM和TN含量是在自然狀態(tài)下風(fēng)干土壤樣品后測(cè)定的。
方法
研究中選擇的聚類(lèi)方法為K-means,回歸算法為RF和XGBoost。分兩步法,在第一步中,我們使用 k 均值簇類(lèi)將小麥光譜劃分為各種小麥光譜簇類(lèi)。該劃分基于176個(gè)波段光譜反射率的合成,并將SAD設(shè)置為算法的判別距離。我們?cè)贛ATLAB中生成了簇類(lèi),最大簇類(lèi)數(shù)設(shè)置為30。在第二步中,對(duì)于小麥光譜的每個(gè)簇類(lèi),我們構(gòu)建了每個(gè)光譜簇類(lèi)的回歸模型,并基于RF和XGBoost算法測(cè)量了SPAD值。因此,每個(gè)光譜簇類(lèi)都有相應(yīng)的回歸模型。
冬小麥SPAD估測(cè)流程圖
SPAD估測(cè)流程圖
結(jié)果表明
所有評(píng)估模型均適用于基于無(wú)人機(jī)高光譜成像數(shù)據(jù)的小麥SPAD估計(jì),R2> 0.75,RMSE < 3.10,MAPE < 6%。與非聚類(lèi)回歸相比,通過(guò)與聚類(lèi)的第一步耦合,可以在一定程度上提高模型性能。對(duì)于 RF,R2提高了18.1%(從0.763提高到0.901),RMSE下降了39.7%(從3.01提高到1.813),MAPE下降了47.4%(從5.99%下降到3.15%);對(duì)于 XGBoost,R2提高了18.4%(從0.781提高到0.925),RMSE下降了50.2%(從2.90%下降到1.444%),MAPE下降了59.5%(從5.83%下降到2.36%)。另一方面,聚類(lèi)回歸模型的預(yù)測(cè)結(jié)果比非聚類(lèi)回歸模型表現(xiàn)出更大的空間變異。聚類(lèi)回歸模型的平均值與全局模型的平均值更接近。總的來(lái)說(shuō),聚類(lèi)-XGBoost模型在所有情況下都表現(xiàn)出更好的SPAD估計(jì)性能。因此,通過(guò)光譜聚類(lèi)進(jìn)行差分建模適用于不同的條件,如不同施肥處理的田地,模型性能優(yōu)于全局建模。此外,我們發(fā)現(xiàn),利用土壤OM和土壤TN作為補(bǔ)充模型輸入特征,小麥SPAD估計(jì)模型的精度顯著提高。因此,土壤養(yǎng)分?jǐn)?shù)據(jù)可用于未來(lái)小麥SPAD反演。
來(lái)源:Yang, X., Yang, R., Ye, Y., Yuan, Z.R., Wang, D.Z., & Hua, K.K. (2021). Winter wheat SPAD estimation from UAV hyperspectral data using cluster-regression methods. International Journal of Applied Earth Observations and Geoinformation, 105, 102618.